Lemmikeiltä alkaa kadota tavaroita samana päivänä, kun kauppaan astelee eriskummallinen orava. My Littlest Pet Shop kertoo pienestä mutta ystävällisestä lemmikkieläinkaupasta, jonka veikeät lemmikit osaavat puhua - mutta vain kaupan yläkertaan muuttaneelle Blythelle.